제2회 남북경협아카데미는 상반기 제1회 남북경협아카데미의 경험을 밑바탕 삼아 업그레이드 되었으며, 워크샵(6주차, 1박2일)을 비롯해서 12주 동안 총 11명의 북한 및 남북경협 전문가들의 강좌로 진행된다. 제2회 남북경협아카데미는 참석자들이 각자에게 맞는 실제적인 경협아이디어를 찾아 발표하는 학기프로젝트를 수행하며, 향후 1기 수료자들을 중심으로 진행 중인 남북경협네트워크(가칭)에 합류할 계획이다.
프로그램은 ‘남북경협의 이해와 실제’, ‘대북농업협력의 실제’, ‘북한주민의 경제생활’, ‘대북인도지원사업의 실제’, ‘복음통일을 위한 기독실업인 역할’ 등의 주제를 다루며 정은찬 통일교육원 교수, 허문영 평화한국 대표, 박세영 평화사업소 소장 등이 강사로 나선다.